Informations Générales
- Intitulé du poste : Ingénieur(e) d’Études en microbiologie moléculaire et cellulaire
- Contrat : CDD de 12 mois (début avant fin année 2026)
- Lieux d’exercice : Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB, UMR7283, Marseille) et déplacements réguliers au BIAM (CEA Cadarache, Saint-Paul-lez-Durance).
Mission Principale
Dans le cadre du projet A*Midex TBMTM, l’ingénieur(e) d’études recruté(e) aura pour mission principale de générer une banque de mutants de délétion ciblés chez la bactérie utilisée au laboratoire, de réaliser des expériences de localisation protéique par microscopie à fluorescence, et d’assurer le phénotypage fonctionnel de la motilité en puces microfluidiques en interaction directe avec les partenaires du consortium au BIAM (CEA Cadarache).
Activités Principales et Tâches Associées
- Génétique Bactérienne & Biologie Moléculaire : Construction de mutants de délétion de gènes cibles. Construction de fusions traductionnelles (fluorochromes).
- Microscopie à Fluorescence & Imagerie Cellulaire : Acquisition autonome des images sur les microscopes du laboratoire. Effectuer le traitement primaire des données d’imagerie.
- Phénotypage de la motilité en Microfluidique : Réaliser les expériences de microfluidique (en partenariat avec le BIAM).
- Biochimie de base : Réaliser les électrophorèses (SDS-PAGE) et les Western blots de routine.
Compétences Requises
- Connaissances théoriques : Connaissances en microbiologie moléculaire et génétique bactérienne, et biochimie des protéines. Principes théoriques de la microscopie optique et de la fluorescence. Des notions de base en microfluidique serait un plus
- Compétences techniques : Maîtrise des outils de biologie moléculaire : PCR, clonage, transformation (conjugaison), techniques de mutagenèse dirigée / délétion chez les bactéries. Pratique de la microscopie à fluorescence : Autonomie complète dans la préparation d’échantillons vivants (ex : pads d’agarose) et l’acquisition d’images. Maîtrise des protocoles de biochimie de routine : Électrophorèse de protéines, transfert et révélation par Western blot.
Profil Recherché
Titulaire d’un Master 2 ou diplôme d’Ingénieur avec expérience dans le domaine de la microbiologie, de la biologie moléculaire, de la biochimie des protéines et de la microscopie.
Contact
Dr. François ALBERTO, LCB, UMR 7283, AMU CNRS
francois.alberto@univ-amu.fr
General Information
Job Title: Research Assistant / Associate (Ingénieur d’Études) in Molecular and Cellular Microbiology
Contract: 12-month fixed-term contract (starting before the end of 2026)
Workplace: Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB, UMR7283, Marseille) with regular travel to BIAM (CEA Cadarache, Saint-Paul-lez-Durance).
Main Purpose of the Role
As part of the A*Midex TBMTM project, the successful candidate will primarily generate a targeted deletion mutant library in the laboratory’s model bacterium, perform protein localization experiments using fluorescence microscopy, and carry out functional motility phenotyping on microfluidic chips in direct collaboration with consortium partners at BIAM (CEA Cadarache).
Key Responsibilities and Associated Tasks
Bacterial Genetics & Molecular Biology: Construction of targeted gene deletion mutants; construction of translational fusions (fluorophores).
Fluorescence Microscopy & Cellular Imaging: Autonomous image acquisition on laboratory microscopes; initial imaging data processing.
Motility Phenotyping via Microfluidics: Performing microfluidic experiments (in partnership with BIAM).
Standard Biochemistry: Running routine electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blot analyses.
Required Skills
Theoretical Knowledge: Solid background in molecular microbiology, bacterial genetics, and protein biochemistry; understanding of the principles of optical and fluorescence microscopy; basic knowledge of microfluidics is a plus.
Technical Skills: Proficiency in standard molecular biology techniques: PCR, cloning, transformation (conjugation), targeted mutagenesis / deletion methods in bacteria. Practical experience in fluorescence microscopy: full autonomy in live-sample preparation (e.g., agarose pads) and image acquisition. Proficiency in routine biochemistry workflows: protein electrophoresis, Western blot transfer and detection.
Candidate Profile
Holder of a Master’s degree (MSc) or an Engineering degree with practical experience in microbiology, molecular biology, protein biochemistry, and microscopy.
Contact
Dr. François ALBERTO, LCB, UMR 7283, AMU CNRS
francois.alberto@univ-amu.fr
